18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2996 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  49.26 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  35.66 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  35.66 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  36 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  33.08 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  34.45 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  32.35 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  29.5 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  29.66 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  32.84 
 
 		 211 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  34.09 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  35.58 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  31.75 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  35.48 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.36 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  32.37 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>