16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3089 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  38.54 
 
 
237 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  33.87 
 
 
219 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  29.85 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  31.51 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  26.06 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  30.97 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  29.5 
 
 
144 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  27.66 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  29.03 
 
 
286 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  26.95 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  29.41 
 
 
215 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  26.95 
 
 
234 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  28.11 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>