23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2804 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  99.05 
 
 
234 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  99.05 
 
 
210 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  70.81 
 
 
210 aa  254  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  70.16 
 
 
211 aa  251  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  47.14 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  51.01 
 
 
207 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  51.71 
 
 
216 aa  161  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  46.92 
 
 
215 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  49.27 
 
 
286 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  48 
 
 
212 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  45.89 
 
 
215 aa  140  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  38.31 
 
 
219 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  41 
 
 
220 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  33.12 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  36 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  27.33 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  36.81 
 
 
216 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  32.23 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  37.41 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  27.57 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.58 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>