23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  57.28 
 
 
210 aa  221  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  59.49 
 
 
207 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  56.22 
 
 
216 aa  205  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  57.07 
 
 
286 aa  201  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  51.46 
 
 
215 aa  178  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  50.25 
 
 
210 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  49.75 
 
 
212 aa  157  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  47.94 
 
 
211 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  46.84 
 
 
219 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  46.38 
 
 
234 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  45.45 
 
 
210 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  45.89 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  45.05 
 
 
220 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 
327 aa  98.2  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  38.66 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  38.66 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  34.84 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  29 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  29.94 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  33.59 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  42.86 
 
 
316 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>