17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2264 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  90.28 
 
 
216 aa  332  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  40.53 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  36.22 
 
 
210 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  40.59 
 
 
286 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  36.82 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  41.23 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  39.2 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  39.2 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  39.2 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  36.17 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  38.66 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  40.24 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  37.19 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  35.96 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>