18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2120 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  90.28 
 
 
219 aa  315  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  37.95 
 
 
207 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  35.71 
 
 
210 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  39.27 
 
 
216 aa  99  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  39.47 
 
 
286 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  40.28 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  33.81 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  38.15 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  38.15 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  38.15 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  36.45 
 
 
215 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  38.66 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  38.92 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  34.57 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  36.67 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  26.16 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>