21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1590 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  53.93 
 
 
207 aa  187  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  48.02 
 
 
210 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  49.76 
 
 
216 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  49.51 
 
 
215 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  49.28 
 
 
286 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  48.07 
 
 
210 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  48.07 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  48.07 
 
 
234 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  44.9 
 
 
211 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  49.75 
 
 
215 aa  148  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  44.93 
 
 
219 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  45.19 
 
 
210 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  45.18 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  38.46 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  37.9 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  26.42 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  24.23 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  32.31 
 
 
144 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>