129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3360 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  72.41 
 
 
89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  66.67 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  67.82 
 
 
87 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  69.88 
 
 
83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  70 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  68.75 
 
 
89 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  62.03 
 
 
90 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  59.76 
 
 
89 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  59.76 
 
 
89 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  59.76 
 
 
89 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  58.54 
 
 
89 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  61.54 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  61.54 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  61.54 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  57.32 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  57.89 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  56.1 
 
 
89 aa  94  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  62.32 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  54.88 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  56.63 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  58.97 
 
 
85 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  51.72 
 
 
85 aa  87.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  51.72 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  54.02 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 
90 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  51.28 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  53.16 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  51.28 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  48.72 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  47.87 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  44.32 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  49.37 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28120  hypothetical protein  54.24 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  44.26 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  37.8 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0277  protein of unknown function DUF156  31.75 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00351414  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  39.06 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0184  hypothetical protein  29.03 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  36.49 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  42.31 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  32.86 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  37.33 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0121  hypothetical protein  34.92 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  34.18 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  38.16 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  43.75 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  43.64 
 
 
88 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  38.46 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0837  hypothetical protein  38.03 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0492349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  38.24 
 
 
92 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  37.84 
 
 
87 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  32.2 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  39.29 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  33.96 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  32.2 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  31.33 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1531  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  37.33 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2968  hypothetical protein  28.41 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  41.82 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0240  protein of unknown function DUF156  23.17 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2187  hypothetical protein  31.25 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1898  hypothetical protein  31.25 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  35.14 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  28.21 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  32.08 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  32.08 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  32.08 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  32.08 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  32.08 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  39.06 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  38.6 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  26.92 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  36.62 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2351  protein of unknown function DUF156  30.51 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  30.36 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  32.08 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  26.92 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  32.08 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  38.75 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  36.23 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  39.62 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  34.55 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>