39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28120  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  235  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  65.52 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  63.79 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  56.9 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  51.67 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  55.56 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  54.84 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  54.84 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  54.84 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  55 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  62.5 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  53.23 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  53.23 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  51.61 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  51.61 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  51.61 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  51.61 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  49.15 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  53.23 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  53.97 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  50.82 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  51.61 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  54.24 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  47.95 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  43.66 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  51.67 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  46.77 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  47.54 
 
 
90 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  46.77 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  46.55 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  45.16 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  45.16 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  56.76 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  44.23 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  44.23 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  31.43 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  41.46 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>