More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0402 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0402  ABC transporter related  100 
 
 
337 aa  689    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280128  normal  0.577694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  51.79 
 
 
338 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  50.89 
 
 
338 aa  342  8e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  51.05 
 
 
338 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  49.55 
 
 
338 aa  338  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  49.26 
 
 
338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  49.26 
 
 
338 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  49.26 
 
 
338 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  49.26 
 
 
338 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  48.96 
 
 
338 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2221  ABC transporter related  48.53 
 
 
340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2534  ABC transporter related protein  52.46 
 
 
340 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 
339 aa  317  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  46.9 
 
 
339 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
339 aa  315  9e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
339 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
339 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
339 aa  315  9e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  46.67 
 
 
344 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.9 
 
 
385 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.9 
 
 
385 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.9 
 
 
344 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  45.59 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  48.25 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.46 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.41 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.46 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.71 
 
 
344 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.55 
 
 
350 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  45 
 
 
340 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.29 
 
 
348 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 
345 aa  301  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.97 
 
 
349 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 
344 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.97 
 
 
349 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 
359 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  44.93 
 
 
342 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  45.51 
 
 
354 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 
344 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 
344 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 
344 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.37 
 
 
344 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 
344 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.11 
 
 
343 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 
344 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 
344 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 
344 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.71 
 
 
344 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  46.09 
 
 
347 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 
343 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
343 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  44.61 
 
 
388 aa  292  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  47.23 
 
 
341 aa  291  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.79 
 
 
344 aa  291  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0274  ABC transporter related  47.58 
 
 
342 aa  291  9e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.4 
 
 
344 aa  291  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  44.41 
 
 
340 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.98 
 
 
343 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  46.84 
 
 
350 aa  290  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.1 
 
 
348 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.1 
 
 
348 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 
343 aa  288  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
346 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  44.28 
 
 
340 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  41.4 
 
 
344 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 
346 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
338 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  47.8 
 
 
349 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  41.69 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  41.69 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  46.06 
 
 
342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.95 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  45.32 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.55 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.68 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  43.19 
 
 
345 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  44.68 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.08 
 
 
352 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>