26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3060 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3060  solute-binding family 7 protein  100 
 
 		 347 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  0.298604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0634  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3715  twin-arginine translocation pathway signal  24 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000597887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2456  Extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1609  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.16 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2184  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.24 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3772  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.17 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3747  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.25 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.706849  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5333  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.39 
 
 		 332 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4505  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.09 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4546  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  32.2 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0034  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.95 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3540  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.68 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151055  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1456  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.44 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0624935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2483  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.74 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0131179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0085  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.16 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0303  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.42 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3368  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.85 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2479  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.68 
 
 		 336 aa  46.2  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1377  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.81 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1602  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.9 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1840  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.94 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000139168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1777  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.71 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0643258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3913  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.96 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1969  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.56 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2369  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.56 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.019871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>