123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0010 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0010  IS91, transposase, truncation  100 
 
 
284 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0100  IS91 ORF  93.17 
 
 
410 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  38.6 
 
 
393 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  35.58 
 
 
397 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  35.58 
 
 
396 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  35.58 
 
 
396 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  35.58 
 
 
397 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  35.58 
 
 
396 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  35.58 
 
 
358 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  35.58 
 
 
397 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  35.58 
 
 
397 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  35.58 
 
 
397 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  35.58 
 
 
397 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  35.58 
 
 
397 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  35.58 
 
 
396 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  35.58 
 
 
396 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  35.58 
 
 
359 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  35.58 
 
 
359 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  35.58 
 
 
396 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  35.58 
 
 
359 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  35.58 
 
 
396 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  35.58 
 
 
396 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  35.58 
 
 
359 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  35.58 
 
 
397 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  35.58 
 
 
397 aa  178  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  35.58 
 
 
359 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  32.97 
 
 
409 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  32.97 
 
 
409 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  32.33 
 
 
399 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  32.33 
 
 
394 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  32.68 
 
 
399 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  32.28 
 
 
402 aa  152  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0095  hypothetical protein  91.3 
 
 
73 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134415  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0008  IS91, transposase, truncation  96.08 
 
 
57 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  26.95 
 
 
429 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0001  IS1294, transposase, truncation  32.05 
 
 
193 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.040816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  24.12 
 
 
391 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  24.12 
 
 
391 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0824  hypothetical protein  24.05 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0266  hypothetical protein  24.05 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0558  hypothetical protein  24.05 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0535  hypothetical protein  24.05 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0859  hypothetical protein  24.05 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0058  hypothetical protein  24.05 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0523  hypothetical protein  24.05 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1013  hypothetical protein  23.63 
 
 
407 aa  87  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1234  hypothetical protein  23.63 
 
 
407 aa  87  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0810  hypothetical protein  23.63 
 
 
407 aa  87  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  29.53 
 
 
365 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  27.72 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  26.98 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  26.98 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  26.98 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  27 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  27.46 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  26.34 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  27.81 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  27.08 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  27.08 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  27.08 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  27.08 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  27.81 
 
 
342 aa  72  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0365  putative transposase  25 
 
 
388 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.057361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  27.27 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  27.27 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  27.81 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  27.81 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  27.81 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  25 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  24.48 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  24.09 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  26.78 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  27.57 
 
 
398 aa  65.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  25.45 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  28.97 
 
 
401 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  25.59 
 
 
398 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  28.8 
 
 
374 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  27.08 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  24.36 
 
 
374 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>