43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0119 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0119  transposase IS3/family protein  100 
 
 
38 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.41169  normal  0.527236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  93.33 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0739  putative transposase  84.38 
 
 
43 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.646917  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  83.33 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  86.67 
 
 
118 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  86.67 
 
 
118 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  80 
 
 
57 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  80 
 
 
57 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  67.74 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  67.74 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  72.41 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  72.41 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  72.41 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  72.41 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  68.97 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  68.97 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  68.97 
 
 
95 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  72.41 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  72.41 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  65.52 
 
 
383 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  62.07 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  62.07 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>