19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4288 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  85.73 
 
 		 1032 bp  735    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4288    100 
 
 		 846 bp  1677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  84.91 
 
 		 1032 bp  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4791    89.81 
 
 		 501 bp  438  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4873    89.28 
 
 		 501 bp  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0108848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  82.86 
 
 		 1032 bp  196  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0264    83.03 
 
 		 423 bp  176  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3978    86.29 
 
 		 249 bp  176  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    80.23 
 
 		 819 bp  147  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0265    82.93 
 
 		 183 bp  117  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  92.59 
 
 		 219 bp  113  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1818    90.22 
 
 		 195 bp  111  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.429774  hitchhiker  0.000000000632842 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  91.36 
 
 		 219 bp  105  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1819    87 
 
 		 165 bp  95.6  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.290757  hitchhiker  0.000000000543765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  87.78 
 
 		 588 bp  91.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1817    87.36 
 
 		 183 bp  85.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.427269  hitchhiker  0.000000000610263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2897  hypothetical protein  88.52 
 
 		 261 bp  65.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4040    96.97 
 
 		 1021 bp  58  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2577  IS630 orf  100 
 
 		 261 bp  52  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.093225  normal  0.748491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>