12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0265 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0265    100 
 
 		 183 bp  363  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  98.89 
 
 		 1032 bp  341  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  97.78 
 
 		 1032 bp  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4791    97.44 
 
 		 501 bp  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4873    97.4 
 
 		 501 bp  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0108848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1818    91.43 
 
 		 195 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.429774  hitchhiker  0.000000000632842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4288    82.93 
 
 		 846 bp  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  81.63 
 
 		 1032 bp  77.8  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2897  hypothetical protein  90.91 
 
 		 261 bp  69.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    80.14 
 
 		 819 bp  60  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4040    87.04 
 
 		 1021 bp  52  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2430    84.13 
 
 		 831 bp  46.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>