21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0069 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  93.56 
 
 		 1032 bp  1144    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    100 
 
 		 819 bp  1624    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  94.98 
 
 		 219 bp  347  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  94.98 
 
 		 219 bp  347  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  80.3 
 
 		 1032 bp  250  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  79.12 
 
 		 1032 bp  194  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0264    80.88 
 
 		 423 bp  190  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4288    80.23 
 
 		 846 bp  147  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0038  description: insertion element; ORF5 protein  84.44 
 
 		 141 bp  101  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0102  hypothetical protein  97.56 
 
 		 396 bp  73.8  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4873    79.31 
 
 		 501 bp  69.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0108848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4791    79.31 
 
 		 501 bp  69.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2897  hypothetical protein  90.57 
 
 		 261 bp  65.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0112  RNA-directed DNA polymerase  95.12 
 
 		 285 bp  65.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.690611  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0265    80.14 
 
 		 183 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  84.42 
 
 		 588 bp  58  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2987    88 
 
 		 796 bp  52  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58251  hitchhiker  0.0000281977 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  94.12 
 
 		 672 bp  52  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2497    88 
 
 		 796 bp  52  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.59656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4040    93.94 
 
 		 1021 bp  50.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2430    88.64 
 
 		 831 bp  48.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>