12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4791 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4791    100 
 
 		 501 bp  993    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4873    98 
 
 		 501 bp  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0108848 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  94.53 
 
 		 1032 bp  595  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  92.97 
 
 		 1032 bp  547  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4288    89.81 
 
 		 846 bp  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3978    89.05 
 
 		 249 bp  234  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  80.26 
 
 		 1032 bp  159  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  82.12 
 
 		 588 bp  155  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0265    97.44 
 
 		 183 bp  139  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1819    88.64 
 
 		 165 bp  95.6  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.290757  hitchhiker  0.000000000543765 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    79.31 
 
 		 819 bp  69.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4040    86.67 
 
 		 1021 bp  56  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>