16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4040 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4040    100 
 
 		 1021 bp  2024    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1282    89.85 
 
 		 542 bp  632  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2897  hypothetical protein  90.74 
 
 		 261 bp  67.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  87.69 
 
 		 1032 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2430    87.5 
 
 		 831 bp  63.9  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  88.89 
 
 		 1038 bp  60  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  96.97 
 
 		 219 bp  58  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  86.15 
 
 		 1032 bp  58  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4288    96.97 
 
 		 846 bp  58  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4791    86.67 
 
 		 501 bp  56  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4873    86.67 
 
 		 501 bp  56  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0108848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  85.71 
 
 		 1038 bp  54  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  85.71 
 
 		 1038 bp  54  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0265    87.04 
 
 		 183 bp  52  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  93.94 
 
 		 219 bp  50.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    93.94 
 
 		 819 bp  50.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>