12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4873 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4791    98 
 
 		 501 bp  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4873    100 
 
 		 501 bp  993    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0108848 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  93.99 
 
 		 1032 bp  577  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  92.43 
 
 		 1032 bp  529  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4288    89.28 
 
 		 846 bp  422  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3978    88.1 
 
 		 249 bp  218  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  81.75 
 
 		 588 bp  147  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  79.74 
 
 		 1032 bp  143  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0265    97.4 
 
 		 183 bp  137  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1819    87.5 
 
 		 165 bp  87.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.290757  hitchhiker  0.000000000543765 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    79.31 
 
 		 819 bp  69.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4040    86.67 
 
 		 1021 bp  56  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>