9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1819 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1819    100 
 
 		 165 bp  327  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.290757  hitchhiker  0.000000000543765 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  93.81 
 
 		 1032 bp  145  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  91.75 
 
 		 1032 bp  129  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4791    88.64 
 
 		 501 bp  95.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4288    87 
 
 		 846 bp  95.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4873    87.5 
 
 		 501 bp  87.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0108848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  91.67 
 
 		 1032 bp  79.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3978    82.95 
 
 		 249 bp  56  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  81.61 
 
 		 588 bp  46.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>