19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2430 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3020    90.52 
 
 		 968 bp  1021    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2430    100 
 
 		 831 bp  1647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  83.33 
 
 		 1038 bp  531  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  83.33 
 
 		 1038 bp  531  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  81.64 
 
 		 1038 bp  436  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  81.36 
 
 		 1038 bp  400  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2894    83.77 
 
 		 918 bp  125  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3054    88.06 
 
 		 339 bp  69.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4040    87.5 
 
 		 1021 bp  63.9  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  87.3 
 
 		 1032 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  86.57 
 
 		 1032 bp  61.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  86.57 
 
 		 1032 bp  61.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  86.57 
 
 		 1032 bp  61.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2987    87.1 
 
 		 796 bp  60  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58251  hitchhiker  0.0000281977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2897  hypothetical protein  86.89 
 
 		 261 bp  58  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  85.71 
 
 		 1032 bp  54  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2497    85.48 
 
 		 796 bp  52  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.59656  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  88.89 
 
 		 1032 bp  50.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    88.64 
 
 		 819 bp  48.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>