10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2987 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2497    99.87 
 
 		 796 bp  1564    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.59656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2987    100 
 
 		 796 bp  1578    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58251  hitchhiker  0.0000281977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2896  transposase  92.73 
 
 		 234 bp  309  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2897  hypothetical protein  94.74 
 
 		 261 bp  89.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  83.7 
 
 		 1032 bp  63.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  83.7 
 
 		 1032 bp  63.9  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  83.7 
 
 		 1032 bp  63.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2430    87.1 
 
 		 831 bp  60  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    88 
 
 		 819 bp  52  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3020    86.54 
 
 		 968 bp  48.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>