15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3020 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2430    90.52 
 
 		 831 bp  1021    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3020    100 
 
 		 968 bp  1919    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  81.4 
 
 		 1038 bp  466  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  81.4 
 
 		 1038 bp  466  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  80.74 
 
 		 1038 bp  430  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  79.96 
 
 		 1038 bp  355  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3054    89.6 
 
 		 339 bp  226  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2894    80.1 
 
 		 918 bp  75.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2897  hypothetical protein  86.89 
 
 		 261 bp  58  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  85.07 
 
 		 1032 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  85.07 
 
 		 1032 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  85.07 
 
 		 1032 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  85.71 
 
 		 1032 bp  54  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2497    86.54 
 
 		 796 bp  48.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.59656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2987    86.54 
 
 		 796 bp  48.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58251  hitchhiker  0.0000281977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>