17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2894 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2894    100 
 
 		 918 bp  1820    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3080    89.97 
 
 		 795 bp  799    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  85.02 
 
 		 795 bp  523  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  86.53 
 
 		 1038 bp  168  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  86.53 
 
 		 1038 bp  168  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  86.01 
 
 		 1038 bp  161  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  84.62 
 
 		 1038 bp  141  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2430    83.77 
 
 		 831 bp  125  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2941    80 
 
 		 468 bp  103  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265851  hitchhiker  2.79583e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  84.14 
 
 		 624 bp  99.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  83.45 
 
 		 624 bp  91.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3020    80.1 
 
 		 968 bp  75.8  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2847    80.79 
 
 		 171 bp  71.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4894    79.53 
 
 		 486 bp  71.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0150722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0516    85.9 
 
 		 81 bp  67.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1068    94.29 
 
 		 258 bp  54  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354218  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0327    84.51 
 
 		 195 bp  54  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.949181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>