18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0264 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  97.16 
 
 		 1032 bp  743    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  99.29 
 
 		 1032 bp  815    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0264    100 
 
 		 423 bp  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  84.05 
 
 		 1032 bp  301  8e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1817    92.31 
 
 		 183 bp  250  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.427269  hitchhiker  0.000000000610263 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    80.88 
 
 		 819 bp  190  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  85.58 
 
 		 219 bp  180  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  85.58 
 
 		 219 bp  180  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4288    83.03 
 
 		 846 bp  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1816    93.41 
 
 		 147 bp  125  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410783  hitchhiker  0.000000000632842 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0038  description: insertion element; ORF5 protein  85.19 
 
 		 141 bp  109  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1818    91.8 
 
 		 195 bp  81.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.429774  hitchhiker  0.000000000632842 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  85.48 
 
 		 1038 bp  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  85.25 
 
 		 1038 bp  50.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  100 
 
 		 672 bp  48.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  100 
 
 		 2481 bp  46.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3020    100 
 
 		 968 bp  46.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  100 
 
 		 2448 bp  46.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>