8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1816 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1816    100 
 
 		 147 bp  291  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410783  hitchhiker  0.000000000632842 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  94.51 
 
 		 1032 bp  133  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0264    93.41 
 
 		 423 bp  125  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  91.21 
 
 		 1032 bp  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  85.06 
 
 		 1032 bp  61.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  84.88 
 
 		 219 bp  60  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  83.91 
 
 		 219 bp  54  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0069    87.23 
 
 		 819 bp  46.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>