More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2624 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
160 aa  315  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2332  acetolactate synthase, small subunit  69.81 
 
 
159 aa  225  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3130  acetolactate synthase, small subunit  65.62 
 
 
160 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2685  acetolactate synthase, small subunit  48.1 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.176029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  41.4 
 
 
166 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.13 
 
 
170 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.13 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  38.46 
 
 
159 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  36.71 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  40.13 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  38.22 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  42.68 
 
 
165 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  38.85 
 
 
165 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.58 
 
 
172 aa  123  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.18 
 
 
174 aa  123  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  40.76 
 
 
172 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  40.76 
 
 
172 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.85 
 
 
169 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.85 
 
 
169 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.1 
 
 
168 aa  120  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2228  acetolactate synthase, small subunit  40.13 
 
 
176 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.85 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.22 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  39.87 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.46 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.58 
 
 
161 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  37.82 
 
 
167 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  36.31 
 
 
170 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  36.25 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.46 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  35.67 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.11 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.82 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.18 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  37.82 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.03 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.22 
 
 
172 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.22 
 
 
172 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.97 
 
 
169 aa  115  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.22 
 
 
172 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.46 
 
 
176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.94 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502745  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  37.97 
 
 
207 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_002936  DET0832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
178 aa  114  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.199975  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.49 
 
 
176 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_736  acetolactate synthase, small subunit  36.54 
 
 
178 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  35.67 
 
 
173 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0852  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.85 
 
 
159 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.889079  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
178 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  37.18 
 
 
167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  35.26 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  37.18 
 
 
160 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  37.34 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  36.94 
 
 
175 aa  113  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1591  acetolactate synthase, small subunit  35.03 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.9 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0740  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.85 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0742  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.82 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0605  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.48 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.911108  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.82 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
172 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1903  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.54 
 
 
159 aa  112  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  35.48 
 
 
166 aa  111  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
172 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  36.54 
 
 
167 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  35.67 
 
 
161 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
184 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  33.97 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  37.18 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.85 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  33.54 
 
 
162 aa  111  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  37.58 
 
 
167 aa  111  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  32.69 
 
 
185 aa  110  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.62 
 
 
172 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.58 
 
 
168 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.18 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.26 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0601  acetolactate synthase, small subunit  38.61 
 
 
202 aa  110  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.622073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.9 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.62 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3107  acetolactate synthase, small subunit  33.76 
 
 
181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2171  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.96 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.96 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  36.31 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0106  acetolactate synthase, small subunit  35.03 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.39 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.39 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  35.22 
 
 
187 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
174 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.54 
 
 
174 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1849  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.76 
 
 
158 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  33.33 
 
 
172 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.31 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1121  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.44 
 
 
170 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00266912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0104  acetolactate synthase, small subunit  33.76 
 
 
161 aa  107  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.054999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1241  acetolactate synthase, small subunit  35.26 
 
 
179 aa  107  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  33.96 
 
 
166 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>