More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2171 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2171  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
158 aa  315  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0852  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.2 
 
 
159 aa  309  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.889079  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0605  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  91.77 
 
 
158 aa  299  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.911108  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0740  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  91.77 
 
 
159 aa  299  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1903  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  90.51 
 
 
159 aa  291  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0742  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  84.18 
 
 
159 aa  281  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  79.11 
 
 
159 aa  259  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
163 aa  173  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.64 
 
 
168 aa  173  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.04 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.04 
 
 
163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
163 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
163 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
172 aa  164  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  46.5 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  46.5 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.39 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  50.32 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  44.65 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  43.31 
 
 
166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  46.84 
 
 
164 aa  160  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.91 
 
 
164 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  48.72 
 
 
170 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
161 aa  158  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.95 
 
 
163 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.15 
 
 
172 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.31 
 
 
163 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  45.22 
 
 
166 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.22 
 
 
170 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  48.41 
 
 
170 aa  158  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.22 
 
 
176 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.59 
 
 
176 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.4 
 
 
164 aa  157  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  45.22 
 
 
167 aa  157  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.74 
 
 
165 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.59 
 
 
167 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.59 
 
 
167 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  41.14 
 
 
163 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0635  acetolactate synthase, small subunit  46.2 
 
 
163 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1202  acetolactate synthase, small subunit  46.79 
 
 
183 aa  155  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  48.08 
 
 
174 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.31 
 
 
182 aa  154  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.95 
 
 
176 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.44 
 
 
174 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.59 
 
 
172 aa  154  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.31 
 
 
163 aa  154  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  44.87 
 
 
169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  45.86 
 
 
172 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  45.86 
 
 
172 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.15 
 
 
184 aa  153  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.87 
 
 
175 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.95 
 
 
169 aa  152  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.51 
 
 
174 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.51 
 
 
168 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  46.79 
 
 
167 aa  152  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.31 
 
 
172 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.31 
 
 
172 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.51 
 
 
169 aa  152  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.68 
 
 
176 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  43.67 
 
 
163 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  45.16 
 
 
166 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  43.04 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  42.04 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  45.22 
 
 
165 aa  151  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  42.95 
 
 
187 aa  151  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.16 
 
 
171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.22 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.95 
 
 
169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.31 
 
 
169 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  46.15 
 
 
161 aa  150  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.87 
 
 
174 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.31 
 
 
169 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.67 
 
 
163 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.04 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.15 
 
 
174 aa  150  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  43.59 
 
 
175 aa  150  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.04 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.67 
 
 
163 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.22 
 
 
167 aa  149  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  39.74 
 
 
172 aa  148  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  45.51 
 
 
167 aa  148  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  44.23 
 
 
174 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.52 
 
 
169 aa  147  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.41 
 
 
163 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>