More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0601 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0601  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.622073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2144  acetolactate synthase, small subunit  58.23 
 
 
170 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0207979  normal  0.0119261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  58.33 
 
 
172 aa  178  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  58.33 
 
 
172 aa  178  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1908  acetolactate synthase small subunit  56.41 
 
 
169 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00435991  hitchhiker  0.0000119915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  53.9 
 
 
159 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  57.59 
 
 
164 aa  171  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.55 
 
 
172 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.13 
 
 
170 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
167 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  50.63 
 
 
166 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.23 
 
 
178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  52.23 
 
 
160 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.53 
 
 
161 aa  162  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.85 
 
 
167 aa  161  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  54.9 
 
 
165 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.57 
 
 
172 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
175 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.19 
 
 
161 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.2 
 
 
182 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  48.1 
 
 
166 aa  158  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
169 aa  158  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
169 aa  158  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
169 aa  158  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  52.9 
 
 
168 aa  158  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  50.96 
 
 
167 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.92 
 
 
169 aa  156  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
170 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  50.31 
 
 
172 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 
169 aa  154  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  51.59 
 
 
173 aa  154  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1192  acetolactate synthase, small subunit  48.7 
 
 
202 aa  154  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  48.72 
 
 
165 aa  153  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  51.25 
 
 
161 aa  153  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
167 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
167 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.14 
 
 
178 aa  151  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.199975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
170 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.06 
 
 
172 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.06 
 
 
176 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 
167 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
172 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_736  acetolactate synthase, small subunit  51.55 
 
 
178 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118552  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
174 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
172 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
174 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
174 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
176 aa  148  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  49.36 
 
 
161 aa  148  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0187  acetolactate synthase, small subunit  49.33 
 
 
174 aa  148  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.78 
 
 
176 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  48.1 
 
 
174 aa  147  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1591  acetolactate synthase, small subunit  45.4 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  47.59 
 
 
166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1241  acetolactate synthase, small subunit  44.2 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13211  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
174 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.463823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2595  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.63 
 
 
166 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  46.3 
 
 
171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.7 
 
 
162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.91 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.39 
 
 
166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1967  acetolactate synthase, small subunit  46.84 
 
 
180 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  47.74 
 
 
162 aa  142  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
172 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.91 
 
 
168 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
174 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  45.57 
 
 
174 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 
168 aa  141  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1556  acetolactate synthase, small subunit  45.57 
 
 
180 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.75 
 
 
162 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  46.15 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  48.47 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  45.45 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  45.45 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502745  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2228  acetolactate synthase, small subunit  46.86 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.52 
 
 
163 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
172 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  46.88 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0856  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
172 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  44.87 
 
 
164 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 
163 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.79 
 
 
168 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.87 
 
 
164 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.73 
 
 
184 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.74 
 
 
163 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.87 
 
 
163 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
163 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  45.28 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.52 
 
 
163 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.59 
 
 
172 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.59 
 
 
172 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.59 
 
 
172 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.16 
 
 
163 aa  138  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1878  acetolactate synthase, small subunit  45.18 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0996051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  44.52 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.59 
 
 
164 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>