More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1967 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1967  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
180 aa  363  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1556  acetolactate synthase, small subunit  97.22 
 
 
180 aa  356  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1241  acetolactate synthase, small subunit  81.67 
 
 
179 aa  300  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  61.78 
 
 
173 aa  211  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.99 
 
 
178 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.57 
 
 
172 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  52.76 
 
 
164 aa  178  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  51.88 
 
 
160 aa  177  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  52.53 
 
 
161 aa  174  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0187  acetolactate synthase, small subunit  54.25 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  51.27 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  51.27 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_002936  DET0832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.78 
 
 
178 aa  171  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.199975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.85 
 
 
161 aa  171  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.83 
 
 
167 aa  171  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.75 
 
 
167 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.12 
 
 
170 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_736  acetolactate synthase, small subunit  54.78 
 
 
178 aa  170  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
172 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
172 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0856  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.2 
 
 
172 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  51.55 
 
 
161 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.47 
 
 
182 aa  165  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  50.31 
 
 
167 aa  164  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.47 
 
 
175 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
170 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  50.62 
 
 
169 aa  164  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  46.01 
 
 
166 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.53 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2144  acetolactate synthase, small subunit  53.46 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0207979  normal  0.0119261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  51.27 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.47 
 
 
172 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  46.63 
 
 
172 aa  161  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1908  acetolactate synthase small subunit  52.87 
 
 
169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00435991  hitchhiker  0.0000119915 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  49.69 
 
 
167 aa  160  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2595  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.28 
 
 
166 aa  160  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
172 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  49.68 
 
 
161 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  48.73 
 
 
161 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  49.37 
 
 
165 aa  159  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  48.45 
 
 
162 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  49.37 
 
 
187 aa  157  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.89 
 
 
176 aa  157  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  46.75 
 
 
159 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  48.1 
 
 
165 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.91 
 
 
169 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.51 
 
 
164 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.75 
 
 
161 aa  155  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.28 
 
 
169 aa  154  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.28 
 
 
169 aa  154  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
176 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  46.58 
 
 
174 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  45.16 
 
 
168 aa  153  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.96 
 
 
174 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
172 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
167 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.65 
 
 
169 aa  152  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
167 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  45.96 
 
 
175 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.51 
 
 
168 aa  151  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
166 aa  151  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0605  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.44 
 
 
158 aa  150  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.911108  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
176 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.1 
 
 
174 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1451  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1518  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1320  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1309  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1283  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  45.22 
 
 
185 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1418  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
166 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502745  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.91 
 
 
163 aa  148  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  44.72 
 
 
174 aa  148  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  45.62 
 
 
172 aa  148  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
172 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2863  acetolactate synthase, small subunit  47.2 
 
 
167 aa  148  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
172 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  44.72 
 
 
170 aa  148  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
172 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.12 
 
 
168 aa  148  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08540  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.1 
 
 
169 aa  147  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.097945  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1202  acetolactate synthase, small subunit  45.22 
 
 
183 aa  147  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.75 
 
 
168 aa  147  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.96 
 
 
174 aa  147  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.03 
 
 
184 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.28 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.96 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.28 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  47.13 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1121  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.85 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00266912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3107  acetolactate synthase, small subunit  43.87 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0740  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.87 
 
 
159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0852  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.87 
 
 
159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.889079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.87 
 
 
159 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>