More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0718 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0718  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
433 aa  855    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  44.91 
 
 
446 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  41.57 
 
 
459 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.92 
 
 
443 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.04 
 
 
447 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.04 
 
 
447 aa  363  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  43.93 
 
 
427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  38.94 
 
 
440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.92 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 
445 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.32 
 
 
436 aa  354  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.37 
 
 
434 aa  352  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  40.37 
 
 
434 aa  352  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.38 
 
 
460 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.61 
 
 
433 aa  351  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  39.27 
 
 
443 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 
438 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  40.91 
 
 
445 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.63 
 
 
439 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.81 
 
 
446 aa  349  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.91 
 
 
444 aa  348  8e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.69 
 
 
445 aa  348  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.77 
 
 
453 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.04 
 
 
463 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
436 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  41.1 
 
 
440 aa  347  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 
445 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 
440 aa  346  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.32 
 
 
434 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.55 
 
 
433 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  39.73 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 
447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  35.39 
 
 
453 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.23 
 
 
436 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  39.95 
 
 
445 aa  341  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.63 
 
 
450 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.08 
 
 
441 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 
438 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.04 
 
 
442 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  38.34 
 
 
434 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  39.63 
 
 
436 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.95 
 
 
446 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.48 
 
 
436 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  39.22 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  36.41 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  36.41 
 
 
437 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.08 
 
 
442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  38.95 
 
 
466 aa  339  7e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.99 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.18 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.05 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  37.95 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.55 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.21 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.79 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.17 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.12 
 
 
472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  38.36 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  36.05 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40 
 
 
452 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.7 
 
 
438 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  37.88 
 
 
438 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.18 
 
 
439 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  38.13 
 
 
440 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  38.01 
 
 
450 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  39.16 
 
 
431 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.81 
 
 
437 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  39.91 
 
 
440 aa  335  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  35.83 
 
 
453 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  39.4 
 
 
439 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  38.64 
 
 
447 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  39.17 
 
 
442 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
438 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
438 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  40.36 
 
 
450 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.13 
 
 
448 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.2 
 
 
453 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  36.65 
 
 
449 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  41.5 
 
 
451 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  40.14 
 
 
450 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.76 
 
 
446 aa  330  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.47 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  38.04 
 
 
441 aa  329  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  38.16 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  37.25 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.64 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  36.64 
 
 
436 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  38.03 
 
 
470 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.62 
 
 
478 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.99 
 
 
503 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  36.64 
 
 
435 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.23 
 
 
452 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  38.98 
 
 
449 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  37.5 
 
 
445 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.8 
 
 
478 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.02 
 
 
450 aa  326  5e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  38.04 
 
 
440 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>