190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0347 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0347  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  100 
 
 
209 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218342  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2608  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  65.05 
 
 
217 aa  274  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.469084  normal  0.0132416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  52.5 
 
 
218 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1350  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  55.56 
 
 
216 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  50.76 
 
 
211 aa  209  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  53.65 
 
 
221 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  50.5 
 
 
223 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  50.72 
 
 
221 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  50.24 
 
 
221 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  49.03 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  49 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  48.73 
 
 
236 aa  197  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4520  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  51.78 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3749  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  52.5 
 
 
246 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.219924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3155  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  51.52 
 
 
217 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  52.55 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  45.41 
 
 
207 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0641  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  49.5 
 
 
233 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.614962  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0993  nitroreductase family protein  42.08 
 
 
266 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1054  nitroreductase family protein  42.08 
 
 
207 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122479  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  46.28 
 
 
199 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1328  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.82 
 
 
207 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0684  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.61 
 
 
214 aa  148  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.22 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.5 
 
 
235 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.5 
 
 
324 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.95 
 
 
218 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.31 
 
 
214 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  40 
 
 
230 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  34.15 
 
 
216 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1863  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  38.25 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000280674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.27 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.76 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  36.89 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.9 
 
 
584 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39 
 
 
230 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39 
 
 
230 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.18 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.3 
 
 
235 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2042  nitroreductase  37.69 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.55 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.5 
 
 
231 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.8 
 
 
253 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.8 
 
 
253 aa  128  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.33 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  34.33 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.08 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  38.24 
 
 
269 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.82 
 
 
814 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.36 
 
 
216 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.83 
 
 
219 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.39 
 
 
240 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.82 
 
 
227 aa  121  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.76 
 
 
217 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0087  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
559 aa  118  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.37 
 
 
227 aa  118  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2213  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.69 
 
 
227 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0138908  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2320  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
1580 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
982 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.71 
 
 
218 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  37.56 
 
 
221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.01 
 
 
275 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.96 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.5 
 
 
215 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  37.36 
 
 
219 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  37.36 
 
 
219 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.36 
 
 
219 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.91 
 
 
248 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.51 
 
 
222 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47750  hypothetical protein  35 
 
 
218 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327948  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  37.36 
 
 
351 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.57 
 
 
212 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  33.5 
 
 
216 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  37.36 
 
 
411 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.91 
 
 
249 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  35.53 
 
 
216 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  37.36 
 
 
394 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1657  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.7 
 
 
223 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.21 
 
 
228 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.36 
 
 
247 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.36 
 
 
247 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  34.5 
 
 
216 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.36 
 
 
247 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03753  oxidoreductase protein  36.87 
 
 
216 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4116  hypothetical protein  34.5 
 
 
218 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1233  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.82 
 
 
216 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.99 
 
 
213 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  36.26 
 
 
368 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.26 
 
 
249 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.46 
 
 
210 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2763  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.68 
 
 
228 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0692468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4721  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.39 
 
 
227 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0276935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4807  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.39 
 
 
214 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.84 
 
 
279 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1544  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.54 
 
 
253 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233491  normal  0.110997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.18 
 
 
216 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2803  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.5 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.662243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2149  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.83 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0566543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2617  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.32 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>