More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2405 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2405  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
248 aa  513  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2869  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
272 aa  95.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0562178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
434 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5177  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1270  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
514 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.05 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
586 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3836  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.03 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4190  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
432 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.57 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  26.07 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
270 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  29.29 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
685 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.48 
 
 
410 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.35 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2085  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2157  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.84 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2061  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  25.54 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.53 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1007  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.034979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  21.76 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  27.04 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.9 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.1 
 
 
384 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.48 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  24.31 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
331 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.39 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
412 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 
324 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1615  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.7 
 
 
359 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.96 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  23.5 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.73 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.35 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.72 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25 
 
 
371 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
343 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
420 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  20 
 
 
386 aa  62.8  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.98 
 
 
1157 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
301 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  23.18 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.89 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  26.13 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  21.98 
 
 
338 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.23 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 
329 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  24.57 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0793  putative GAF sensor protein  23.95 
 
 
521 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4279  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
333 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1399  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.81 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>