18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5216 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  100 
 
 		 553 aa  1139    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  46.9 
 
 		 614 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  34.56 
 
 		 525 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  30.85 
 
 		 545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  30.17 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  29.69 
 
 		 626 aa  211  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  29.24 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  26.82 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  32.23 
 
 		 709 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  31.54 
 
 		 767 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  25.05 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  23.66 
 
 		 316 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  22.49 
 
 		 309 aa  53.9  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  24.1 
 
 		 313 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  23.27 
 
 		 305 aa  50.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  21.5 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  23.44 
 
 		 303 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  28.72 
 
 		 777 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>