19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2554 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  63.01 
 
 
307 aa  378  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  57.01 
 
 
316 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  45.62 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  48.4 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  39.03 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  42 
 
 
305 aa  228  8e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  26.19 
 
 
582 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  23.21 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  24.86 
 
 
525 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  32.26 
 
 
496 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  23.47 
 
 
767 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  25.42 
 
 
549 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  22.84 
 
 
709 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  26.6 
 
 
626 aa  55.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  24.1 
 
 
553 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0214  OstA family protein  38.03 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0216  hypothetical protein  38.03 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  23.89 
 
 
560 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>