16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6193 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  100 
 
 		 709 aa  1462    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  33.44 
 
 		 767 aa  341  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  32.49 
 
 		 626 aa  184  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  39.1 
 
 		 614 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  31.63 
 
 		 553 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  35.78 
 
 		 525 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  28.74 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  27.63 
 
 		 582 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  30.48 
 
 		 549 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  29.5 
 
 		 545 aa  107  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  25.58 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  24.59 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  27.92 
 
 		 309 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  22.84 
 
 		 313 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  22.95 
 
 		 316 aa  52  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  20 
 
 		 303 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>