17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1197 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  100 
 
 
545 aa  1122    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  32.64 
 
 
525 aa  263  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  30.85 
 
 
553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  32.58 
 
 
614 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  29.21 
 
 
626 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  25.94 
 
 
560 aa  183  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  27.42 
 
 
582 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  24.45 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  32.37 
 
 
767 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  29.5 
 
 
709 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  21.56 
 
 
496 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  23.21 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  25.56 
 
 
307 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  22.03 
 
 
309 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  24.86 
 
 
305 aa  53.5  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  23.89 
 
 
316 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  20.69 
 
 
396 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>