17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0205 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  47.08 
 
 
313 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  49 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  44.84 
 
 
307 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  43.67 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  36.78 
 
 
396 aa  232  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  35.02 
 
 
303 aa  186  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  24.6 
 
 
525 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  25 
 
 
496 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  27.92 
 
 
709 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  22.03 
 
 
545 aa  57  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  27.98 
 
 
767 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  25.88 
 
 
549 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  22.09 
 
 
553 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  24.46 
 
 
626 aa  53.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  23.15 
 
 
582 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  24 
 
 
560 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>