18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0493 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  100 
 
 
767 aa  1562    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  33.49 
 
 
709 aa  351  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  32.2 
 
 
626 aa  162  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  36.26 
 
 
614 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  33.97 
 
 
582 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  31.54 
 
 
553 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  36.63 
 
 
525 aa  137  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  35.17 
 
 
560 aa  130  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  31.05 
 
 
549 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  32.37 
 
 
545 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  27.06 
 
 
496 aa  90.9  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  25.27 
 
 
396 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  23.59 
 
 
313 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  24.46 
 
 
316 aa  61.6  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  22.65 
 
 
307 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  58.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  27.6 
 
 
309 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  20.65 
 
 
303 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>