14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1971 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  632  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  42.71 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  44.41 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  39.03 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  32.82 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  35.11 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  36.49 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  23.44 
 
 		 553 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  20.65 
 
 		 767 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  24.86 
 
 		 626 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  23.17 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  21.56 
 
 		 549 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  20 
 
 		 709 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  22.73 
 
 		 614 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>