17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2797 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  655    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  57.01 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  58.58 
 
 		 307 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  46.5 
 
 		 396 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  42.71 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  44.21 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  38.87 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  27.53 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  32.12 
 
 		 496 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  23.66 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  24.73 
 
 		 525 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  24.46 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  20.74 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  23.89 
 
 		 545 aa  53.5  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  27.17 
 
 		 626 aa  53.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  22.95 
 
 		 709 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  21.43 
 
 		 560 aa  49.3  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>