14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1594 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  100 
 
 		 560 aa  1162    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  46.36 
 
 		 582 aa  482  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  43.33 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  30.17 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  29.79 
 
 		 626 aa  213  7.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  28.64 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  25.94 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  25.47 
 
 		 614 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  35.17 
 
 		 767 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  28.17 
 
 		 709 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  20.94 
 
 		 496 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  23.2 
 
 		 307 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  21.43 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  24 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>