More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0497 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0497  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
90 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  54.65 
 
 
144 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  54.12 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  52.94 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  53.93 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  51.72 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  55.42 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  49.41 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  43.82 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  47.06 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  48.81 
 
 
147 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  47.62 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  46.67 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  48.28 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  48.28 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  48.28 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  48.24 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  49.4 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  54.12 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  45.35 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  42.7 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  42.7 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  41.67 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  41.67 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  44.19 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  40.45 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  47.67 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  47.67 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  41.24 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  41.86 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  40.45 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  40.45 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  44.94 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  39.33 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  40 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  40.48 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7202  ferric uptake regulator, Fur family  39.33 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  41.86 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  38.37 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  40.48 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  38.46 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  36.05 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  39.08 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  39.29 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  40.7 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  41.11 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  40.96 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  38.55 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  38.37 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  41.98 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  40.7 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  41.98 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  42.11 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  41.25 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  35.96 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  40.7 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  43.53 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  37.04 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  39.29 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  40 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  40 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  37.65 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  40.74 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  43.68 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  38.75 
 
 
161 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  41.25 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 
182 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  41.25 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  38.75 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  38.27 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  43.04 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  34.12 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  36.78 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  38.75 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  38.75 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  38.75 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  37.35 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  36.47 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  41.25 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  39.02 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  38.75 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  37.21 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  33.71 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  43.04 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  37.93 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  35.71 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>