44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1903 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  100 
 
 
514 aa  1051    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  60.62 
 
 
517 aa  631  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  50.1 
 
 
516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  49.03 
 
 
516 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  40.15 
 
 
514 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  40.15 
 
 
514 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  40.15 
 
 
514 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  40.4 
 
 
509 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  35.88 
 
 
502 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  35.88 
 
 
502 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  35.88 
 
 
502 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  33.97 
 
 
502 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  35.69 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  37.03 
 
 
514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  35.69 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  34.13 
 
 
502 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  34.33 
 
 
502 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  34.13 
 
 
502 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  34.13 
 
 
502 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  34.13 
 
 
502 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  34.13 
 
 
502 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  34.13 
 
 
502 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  34.13 
 
 
502 aa  299  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4085  hypothetical protein  24.13 
 
 
476 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000267659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4154  hypothetical protein  24.19 
 
 
476 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00208158  hitchhiker  0.0000186661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4379  hypothetical protein  23.93 
 
 
476 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000924151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4125  protein of unknown function DUF945  23.93 
 
 
476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5005  hypothetical protein  23.02 
 
 
521 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5302  hypothetical protein  23.89 
 
 
476 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0147516  normal  0.759699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4334  hypothetical protein  23.34 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.478027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5451  hypothetical protein  23.21 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.685296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03696  hypothetical protein  23.52 
 
 
476 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.142182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03747  hypothetical protein  23.52 
 
 
476 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1259  hypothetical protein  25.35 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0176  hypothetical protein  25.65 
 
 
501 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785731  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1230  hypothetical protein  25.15 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3982  hypothetical protein  22.87 
 
 
502 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4188  hypothetical protein  23.73 
 
 
502 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169416  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0586  hypothetical protein  22.06 
 
 
485 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0605  hypothetical protein  21.82 
 
 
485 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2685  hypothetical protein  24.67 
 
 
528 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1050  protein of unknown function DUF945  20.17 
 
 
458 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2040  putative lipoprotein  31.82 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3576  hypothetical protein  19.95 
 
 
430 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>