33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0586 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0605  hypothetical protein  99.38 
 
 
485 aa  985    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0586  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  991    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2322  hypothetical protein  29.49 
 
 
452 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2465  hypothetical protein  29.27 
 
 
448 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4615  hypothetical protein  22.27 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1050  protein of unknown function DUF945  20.59 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2685  hypothetical protein  21.71 
 
 
528 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3576  hypothetical protein  21.86 
 
 
430 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  25.25 
 
 
516 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  25 
 
 
516 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0076  hypothetical protein  19.26 
 
 
438 aa  51.2  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0727  hypothetical protein  25.13 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000150296  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2110  hypothetical protein  19.26 
 
 
444 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164188  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1998  protein of unknown function DUF945  24.6 
 
 
445 aa  50.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  21.58 
 
 
514 aa  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  22.25 
 
 
514 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0905  protein of unknown function DUF945  20.2 
 
 
505 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  19.16 
 
 
502 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  19.07 
 
 
502 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  19.07 
 
 
502 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  20.84 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003749  hypothetical protein  23.46 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000113852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  18.94 
 
 
502 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  19.64 
 
 
502 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  20.84 
 
 
502 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  20.61 
 
 
502 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  20.61 
 
 
502 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  20.61 
 
 
502 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  20.61 
 
 
502 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  20.61 
 
 
502 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  20.61 
 
 
502 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  20.37 
 
 
502 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02624  hypothetical protein  22.03 
 
 
420 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>