38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5005 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5451  hypothetical protein  92.49 
 
 		 493 aa  950    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.685296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5005  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1069    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0176  hypothetical protein  40.61 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1230  hypothetical protein  36.44 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1259  hypothetical protein  36.63 
 
 		 502 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3982  hypothetical protein  35.23 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4188  hypothetical protein  35.23 
 
 		 502 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  28.29 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  25.8 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  24.8 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  24.8 
 
 		 514 aa  163  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  26.06 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  25.66 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  25.66 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  25.66 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  25.45 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  25.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  25.45 
 
 		 502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  25.45 
 
 		 502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  25.45 
 
 		 502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  25.87 
 
 		 502 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  25.87 
 
 		 502 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  25.87 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  25.87 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  25.87 
 
 		 502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  25.1 
 
 		 517 aa  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  25.71 
 
 		 514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  23.02 
 
 		 514 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5302  hypothetical protein  24.02 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0147516  normal  0.759699 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4154  hypothetical protein  24.22 
 
 		 476 aa  101  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00208158  hitchhiker  0.0000186661 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4125  protein of unknown function DUF945  24.02 
 
 		 476 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4334  hypothetical protein  24.22 
 
 		 476 aa  100  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.478027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03747  hypothetical protein  24.22 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03696  hypothetical protein  24.22 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.142182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4085  hypothetical protein  23.6 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000267659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4379  hypothetical protein  23.6 
 
 		 476 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000924151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>