46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1708 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  100 
 
 		 502 aa  1016    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  79.68 
 
 		 502 aa  852    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  79.28 
 
 		 502 aa  850    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  99.8 
 
 		 502 aa  1014    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  79.88 
 
 		 502 aa  855    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  99.8 
 
 		 502 aa  1014    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  99.8 
 
 		 502 aa  1015    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  79.88 
 
 		 502 aa  855    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  79.88 
 
 		 502 aa  855    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  73.54 
 
 		 514 aa  749    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  99.8 
 
 		 502 aa  1015    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  79.88 
 
 		 502 aa  854    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  79.88 
 
 		 502 aa  854    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  79.88 
 
 		 502 aa  854    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  79.68 
 
 		 502 aa  850    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  43.06 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  42.8 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  43 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  43 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  38.65 
 
 		 516 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  39.24 
 
 		 516 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  38.21 
 
 		 517 aa  332  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  35.29 
 
 		 514 aa  302  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4085  hypothetical protein  33.06 
 
 		 476 aa  259  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000267659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4125  protein of unknown function DUF945  32.85 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4334  hypothetical protein  32.44 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.478027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5302  hypothetical protein  32.64 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0147516  normal  0.759699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03696  hypothetical protein  32.64 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.142182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03747  hypothetical protein  32.64 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4154  hypothetical protein  32.64 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00208158  hitchhiker  0.0000186661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4379  hypothetical protein  32.64 
 
 		 476 aa  253  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000924151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1259  hypothetical protein  28.37 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1230  hypothetical protein  28.17 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3982  hypothetical protein  27.89 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4188  hypothetical protein  28.31 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5005  hypothetical protein  25.87 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5451  hypothetical protein  26.46 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.685296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0176  hypothetical protein  27.02 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1998  protein of unknown function DUF945  23.88 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1050  protein of unknown function DUF945  23.47 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3576  hypothetical protein  23.45 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2015  hypothetical protein  23.01 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00266925  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0586  hypothetical protein  19.16 
 
 		 485 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  31.63 
 
 		 491 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2703  hypothetical protein  21.63 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0605  hypothetical protein  19.17 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>