24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1050 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1050  protein of unknown function DUF945  100 
 
 		 458 aa  931    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2685  hypothetical protein  27.38 
 
 		 528 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0586  hypothetical protein  20.7 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0605  hypothetical protein  20.7 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  24.36 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  24.36 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  24.36 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  24.17 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  22.31 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4615  hypothetical protein  23.77 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  24.17 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  20.7 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03967  hypothetical protein  21.46 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  19.01 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2465  hypothetical protein  21.46 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0905  protein of unknown function DUF945  23.28 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  20.43 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2322  hypothetical protein  21.02 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  20.77 
 
 		 502 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3576  hypothetical protein  23.25 
 
 		 430 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  20.24 
 
 		 502 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  20.24 
 
 		 502 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  20.24 
 
 		 502 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  23.05 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>