42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2139 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  100 
 
 
517 aa  1050    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  60.43 
 
 
514 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  52.65 
 
 
516 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  52.85 
 
 
516 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  40.35 
 
 
514 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  40.35 
 
 
514 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  40.35 
 
 
514 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  43.67 
 
 
509 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  38.21 
 
 
502 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  38.21 
 
 
502 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  38.21 
 
 
502 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  38.01 
 
 
502 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  38.01 
 
 
502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  38.46 
 
 
514 aa  320  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  35.62 
 
 
502 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  35.42 
 
 
502 aa  312  9e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  35.42 
 
 
502 aa  312  9e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  35.42 
 
 
502 aa  312  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  35.23 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  35.03 
 
 
502 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  35.03 
 
 
502 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  35.03 
 
 
502 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  35.03 
 
 
502 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4154  hypothetical protein  27.69 
 
 
476 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00208158  hitchhiker  0.0000186661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4085  hypothetical protein  27.69 
 
 
476 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000267659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4125  protein of unknown function DUF945  27.69 
 
 
476 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4379  hypothetical protein  27.47 
 
 
476 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000924151  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4334  hypothetical protein  27.69 
 
 
476 aa  157  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.478027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5302  hypothetical protein  27.49 
 
 
476 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0147516  normal  0.759699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03747  hypothetical protein  27.29 
 
 
476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03696  hypothetical protein  27.29 
 
 
476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.142182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5005  hypothetical protein  25.1 
 
 
521 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5451  hypothetical protein  23.48 
 
 
493 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.685296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0176  hypothetical protein  25.1 
 
 
501 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785731  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1259  hypothetical protein  25.44 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3982  hypothetical protein  22.64 
 
 
502 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1230  hypothetical protein  23.74 
 
 
502 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4188  hypothetical protein  22.8 
 
 
502 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169416  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2685  hypothetical protein  22.14 
 
 
528 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1050  protein of unknown function DUF945  21.4 
 
 
458 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1998  protein of unknown function DUF945  20.91 
 
 
445 aa  54.3  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3576  hypothetical protein  22.4 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>