38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4188 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1230  hypothetical protein  91.02 
 
 		 502 aa  916    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1259  hypothetical protein  90.02 
 
 		 502 aa  902    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3982  hypothetical protein  79.24 
 
 		 502 aa  828    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4188  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1018    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0176  hypothetical protein  41.3 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5451  hypothetical protein  35.85 
 
 		 493 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.685296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5005  hypothetical protein  35.23 
 
 		 521 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  27.22 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  27.02 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  27.02 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  27.02 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  27.02 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  27.02 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  26.82 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  26.82 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  26.82 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  28.29 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  28.29 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  28.29 
 
 		 502 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  28.29 
 
 		 502 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  28.09 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  27.27 
 
 		 514 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  25.74 
 
 		 509 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  25.56 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  25.35 
 
 		 514 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  25.35 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  23.73 
 
 		 516 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  23.47 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  23.63 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4154  hypothetical protein  23.76 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00208158  hitchhiker  0.0000186661 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5302  hypothetical protein  23.76 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0147516  normal  0.759699 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4125  protein of unknown function DUF945  23.76 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4334  hypothetical protein  23.72 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.478027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03696  hypothetical protein  23.76 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.142182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03747  hypothetical protein  23.76 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4085  hypothetical protein  23.56 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000267659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  22.8 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4379  hypothetical protein  23.37 
 
 		 476 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000924151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>